Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nrif1Q923B3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrif1Q923B3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nrif1Q923B3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms