Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b3Q921M3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b3Q921M3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms