Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Atl3Q91YH5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atl3Q91YH5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl3Q91YH5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms