Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y09

Pcdhac2, Protocadherin alpha C2, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac2Q91Y09 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhac2Q91Y09 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhac2Q91Y09 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhac2Q91Y09 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhac2Q91Y09 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhac2Q91Y09 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhac2Q91Y09 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhac2Q91Y09 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms