Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trex1Q91XB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trex1Q91XB0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trex1Q91XB0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms