Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Yipf1Q91VU1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yipf1Q91VU1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yipf1Q91VU1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms