Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col26a1Q91VF6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col26a1Q91VF6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col26a1Q91VF6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col26a1Q91VF6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.9 ms