Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd248Q91V98 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd248Q91V98 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd248Q91V98 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd248Q91V98 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd248Q91V98 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd248Q91V98 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd248Q91V98 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd248Q91V98 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms