Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TraipQ8VIG6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TraipQ8VIG6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TraipQ8VIG6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TraipQ8VIG6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms