Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps4aQ8VEJ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps4aQ8VEJ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vps4aQ8VEJ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms