Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc115Q8VE99 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc115Q8VE99 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms