Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgbl1Q8VDV0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgbl1Q8VDV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgbl1Q8VDV0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms