Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM1

Zgpat, Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZgpatQ8VDM1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZgpatQ8VDM1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZgpatQ8VDM1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ZgpatQ8VDM1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZgpatQ8VDM1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms