Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fyco1Q8VDC1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Fyco1Q8VDC1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Fyco1Q8VDC1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Fyco1Q8VDC1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fyco1Q8VDC1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Fyco1Q8VDC1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms