Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt25Q8VCW2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt25Q8VCW2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt25Q8VCW2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177 ms