Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BbxQ8VBW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BbxQ8VBW5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms