Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpsap2Q8R574 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpsap2Q8R574 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpsap2Q8R574 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms