Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc12Q8R344 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc12Q8R344 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc12Q8R344 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms