Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spata4Q8K3V1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spata4Q8K3V1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spata4Q8K3V1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms