Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxn4Q8K3Q3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxn4Q8K3Q3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxn4Q8K3Q3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms