Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf39Q8K2Z2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prpf39Q8K2Z2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prpf39Q8K2Z2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms