Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stx5Q8K1E0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx5Q8K1E0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx5Q8K1E0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx5Q8K1E0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms