Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LgsnQ8CIX8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LgsnQ8CIX8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LgsnQ8CIX8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms