Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc45Q8CIM1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc45Q8CIM1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc45Q8CIM1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms