Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cog3Q8CI04 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog3Q8CI04 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms