Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Setd1bQ8CFT2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Setd1bQ8CFT2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Setd1bQ8CFT2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Setd1bQ8CFT2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setd1bQ8CFT2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setd1bQ8CFT2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setd1bQ8CFT2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setd1bQ8CFT2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Setd1bQ8CFT2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Setd1bQ8CFT2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Setd1bQ8CFT2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms