Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm9955Q8CEJ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm9955Q8CEJ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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