Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup88Q8CEC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup88Q8CEC0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup88Q8CEC0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms