Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klhl11Q8CE33 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl11Q8CE33 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl11Q8CE33 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms