Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atad2Q8CDM1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atad2Q8CDM1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms