Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nrip1Q8CBD1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nrip1Q8CBD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrip1Q8CBD1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrip1Q8CBD1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nrip1Q8CBD1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrip1Q8CBD1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nrip1Q8CBD1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms