Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slfn5Q8CBA2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn5Q8CBA2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn5Q8CBA2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms