Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gpc5Q8CAL5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpc5Q8CAL5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc5Q8CAL5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms