Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BC106179Q8C9L1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BC106179Q8C9L1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms