Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RtknQ8C6B2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RtknQ8C6B2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtknQ8C6B2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms