Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C1R3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C1R3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C1R3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C1R3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C1R3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q8C1R3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8C1R3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8C1R3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C1R3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8C1R3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8C1R3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q8C1R3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8C1R3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms