Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csgalnact2Q8C1F4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csgalnact2Q8C1F4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms