Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TiparpQ8C1B2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TiparpQ8C1B2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TiparpQ8C1B2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms