Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rapgef5Q8C0Q9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rapgef5Q8C0Q9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rapgef5Q8C0Q9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 430.3 ms