Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms