Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TtpaQ8BWP5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TtpaQ8BWP5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TtpaQ8BWP5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms