Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prr9Q8BV84 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prr9Q8BV84 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prr9Q8BV84 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms