Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS47

9430097D07Rik, RIKEN cDNA 9430097D07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430097D07RikQ8BS47 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
9430097D07RikQ8BS47 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9430097D07RikQ8BS47 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms