Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms