Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpc2Q8BKV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc2Q8BKV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc2Q8BKV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms