Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gcfc2Q8BKT3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gcfc2Q8BKT3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms