Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rufy1Q8BIJ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rufy1Q8BIJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms