Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabra5Q8BHJ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms