Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHE5

Bmp3, Bone morphogenetic protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp3Q8BHE5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp3Q8BHE5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bmp3Q8BHE5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bmp3Q8BHE5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms