Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf41Q8BH75 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf41Q8BH75 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms